凱杰qiagen 76506 RNAprotect Bacteria Reagent
凱杰qiagen 76506 RNAprotect Bacteria Reagent
RNAprotect Bacteria Reagent可在RNA純化步驟前立即穩(wěn)定RNA,從而確保可靠的基因表達(dá)和分析數(shù)據(jù)。在細(xì)菌培養(yǎng)基中直接加入試劑即可穩(wěn)定革蘭氏陽性和革蘭氏陰性菌。
凱杰qiagen 76506 RNAprotect Bacteria Reagent
GeneChip分析。
使用RNeasy Protect Bacteria Kit(RNeasy Protect Bacteria)從RNAprotect穩(wěn)定的E. coli培養(yǎng)物中分離總RNA,或者使用商品化的沉淀方法(Supplier EIII)從未穩(wěn)定的培養(yǎng)物中分離總RNA。在分離RNA前將RNA聚合酶抑制劑利福平加入到一半的培養(yǎng)物中,以區(qū)分在限定培養(yǎng)條件下的基因表達(dá)以及在收集和RNA分離過程中人為基因誘導(dǎo)的作用。加入和未加入利福平時轉(zhuǎn)錄水平的差異基本上反映出RNA降解的程度。[A] 參照標(biāo)準(zhǔn)的Affymetrix實驗方案對E. coli微陣列進(jìn)行GeneChip分析。[B] 通過GeneChip分析測得的不同轉(zhuǎn)錄本數(shù)目除以微陣列中的轉(zhuǎn)錄本總數(shù),評估基因表達(dá)百分比。(數(shù)據(jù)來自于與Affymetrix合作開展的一項研究。)
RNAprotect Bacteria Reagent防止mRNA降解。
將RNA聚合酶抑制劑利福平加入到E. coli培養(yǎng)物中,停止轉(zhuǎn)錄,僅監(jiān)測RNA的降解。培養(yǎng)物分為兩半,在其中一半加入RNAprotect Bacteria Reagent。樣本置于室溫0、4、8和16分鐘后離心并分離RNA。采用瓊脂糖凝膠電泳分析獲得的RNA(上圖)。采用northern印跡分析檢查兩半培養(yǎng)物中兩種標(biāo)記基因的表達(dá)。中圖:ompA(半衰期15分鐘);下圖:α-內(nèi)酰胺酶(半衰期2–5分鐘)。